经支气管镜活检术是支气管镜检查中应用频率最高的一种操作技术，肺部大多数疾病，如肿瘤、肉芽肿性疾病、肺间质疾病及某些感染性疾病等都需要通过这种活检术来确诊，通过病理学和细胞学的检查探明病因、探索发病机理，从而有助于选择正确的治疗方法，避免不必要的手术探查。近年来，肺活组织检查术发展迅速，不但方法增多、器械日臻完善，穿刺技术也在不断改进，诊断的准确性日益提高，诊断范围也在不断扩大。
一、经支气管镜活检的适应症
（一）支气管腔内病变: 各种通过支气管镜直视可见的支气管腔内病变：支气管内膜结核、支气管癌、中心型肺癌支气管浸润、支气管淀粉样变及结节病等。
（二）肺内局灶性病变: 支气管镜直视不可见的周围型肺肿块或结节、局限性肺浸润性病变：周围型肺癌、转移瘤、以孤立结节为表现的肺泡癌、结核球及炎性病变等。
（三）肺部弥漫性病变：支气管镜直视不可见的弥漫性病变：原因不明的肺泡炎及肺间质纤维化、肺泡癌及各种炎性病变等。
二、经支气管镜活检的操作方法
（一）经支气管镜活检术（Transbronchil Biopsy, TBB）
经支气管镜活检术（TBB）有两种含义：广义上讲泛指通过支气管镜进行的所有活检术，其中包括经支气管镜肺活检术；狭义上讲是指单纯针对支气管腔内进行的活检术，如支气管粘膜活检、支气管内肿物活检等，不包括肺活检及针吸活检术。本文中如不特别指明，TBB均代表狭义的概念。TBB主要应用于各种支气管腔内病变。
（二）经支气管镜肺活检术（Transbronchil Lung Biopsy, TBLB）
经支气管镜肺活检术（TBLB）主要应用于肺部弥漫性病变及周缘型肺内局灶性病变，由于外周的弥漫性或局灶性病变通过支气管镜是不能见到的，因此有两种方法来实施TBLB ——经X线引导下的TBLB和无X线引导下的TBLB。
（三）保护性毛刷(Protected specimen brush，PSB)技术
纤维支气管镜引导保护性毛刷(PSB)技术减少了标本污染，结合细菌定量培养(Quantitative culture,QC)有较好的准确性和可重复性，是临床较好的选择。
（四）远端支气管肺泡灌洗技术（Distant Bronchoalveolar Lavage，DBL）
支气管肺泡灌洗术是应用纤维支气管镜进行支气管肺泡灌洗，采取肺泡表面衬液进行炎症与免疫细胞及可溶性物质检查的方法。利用支气管肺泡灌洗液可进行细胞学、微生物学、寄生虫学和免疫学等方面的各项检验，对一些下呼吸道疾病的诊断、病情观察、预后判断、研究开辟了一条新途径。
支气管肺泡灌洗术分为两种：全肺灌洗和肺段亚肺段灌洗。全肺灌洗主要用于矽肺及其他无机尘帅、肺泡蛋白沉着症、粘液粘稠病、哮喘重度发作等病症的治疗。肺段亚肺段灌洗多用于采集检验标本。而在治疗方面肺泡灌洗技术则主要用于支气管、肺化脓性感染，气道分泌物、痰栓阻塞等病症的灌洗治疗。
（五）针吸活检术（Transbronchial Needle Aspiration,TBNA）
许多在气管镜直视下不能窥见或仅表现为外压性表现的支气管腔外病变，如纵隔腔或肺门区病变，通常的活检方法不能获得有效的标本，而利用经支气管针吸术，则可较好地获取细胞学或组织学标本。TBNA实质上是应用一种特制的带有可弯曲导管的穿刺针，通过气管镜的活检通道进入气道内，然后穿透气道壁对气管、支气管腔外病变，如结节、肿块、肿大的淋巴结以及肺部的病灶等进行针刺吸引，获取细胞或组织标本进行细胞学和病理学检查。近年来，许多临床医生已认识到该项技术在医疗活动中的重要性，随着操作方法的不断改善和穿刺针的不断改进，这项技术已广泛应用于各种良、恶性肺及纵隔疾病的诊断，极大地提高了气管镜的诊断率和应用范畴。更为重要的是，由于该技术可对纵隔淋巴结进行活检，用以确定肺癌患者的纵隔肿大淋巴结的性质，使气管镜的检查可直接参与肺癌的临床分期，在很大程度上还减少了使用创伤较大的外科分期方法。